با ادامه بحران‌های ناشی از سیل در استان‌های هرمزگان و سیستان و بلوچستان، نگرانی‌ها درباره تهدید سلامت مردم سیل‌زده افزایش یافته و همچنین دانش‌آموزان به دلیل تخریب مدارس و راه‌های ارتباطی با مشکل مواجه شده‌اند.
رییس دانشگاه علوم پزشکی هرمزگان، روز سه‌شنبه اول بهمن‌ماه از ابتلای تعدادی از مردم سیل‌زده این استان به «بیماری‌های اسهالی» به دلیل مشکل آب آشامیدنی سالم خبر داد. او اظهار کرد دست‌کم ۱۸ مورد از این بیماری مشاهده شده است. این کارگزار رژیم همچنین با اشاره به خطر اشاعه بیماری‌های وبا، دیفتری، سیاه‌سرفه و سرخک میان سیل‌زدگان از کمبود واکسن و سرم خبر داد. شهرستان جاسک در هرمزگان از مناطقی است که بیشتر تحت تاثیر سیل قرار گرفت. ۱۴ روستای جاسک هنوز به آب آشامیدنی سالم دسترسی ندارند. هم‌زمان در استان سیستان و بلوچستان نیز سرپرست شبکه بهداشت و درمان چابهار، درباره «بحران آب» و «انتقال بیماری» میان سیل‌زدگان هشدار داده است. او در همین زمینه گفت: “نظارتی بر روی تانکرهایی که در حال توزیع آبند وجود ندارد و مردم نیز به جز این آبی برای مصرف ندارند.”